Bệnh viện Đa khoa TƯ Cần Thơ được xây dựng trên tổng diện tích 61.664m2. Bệnh viện bắt đầu xây dựng với ý tưởng 500 giường bệnh cho tỉnh Cần Thơ cũ, sau đó được nâng lên 700 giường, có nhiệm vụ đào tạo cán bộ cho khu vực Tây Nam Bộ, bổ sung một số chuyên khoa để nâng cấp thành bệnh viện loại 1 hoàn chỉnh của ĐBSCL.
Ngày 27/5/2005, Bệnh viện Đa khoa Cần Thơ chuyển giao về Bộ Y tế quản lý, trở thành Bệnh viện Đa khoa TƯ hiện nay, quy mô 700 giường bệnh gồm 35 khoa phòng (với 20 khoa lâm sàng, 9 khoa cận lâm sàng, 6 phòng chức năng). Tổng số cán bộ công nhân viên hiện nay là 877 người, trong đó 245 trình độ Đại học, 80 sau Đại học từ chuyên khoa I đến Tiến sĩ.
Tuy nhiên, với quy mô là một trung tâm y tế lớn nhất của trung ương tại ĐBSCL vừa có nhiệm vụ chữa bệnh cho nhân dân vừa đào tạo đội ngũ cán bộ y tế trong khu vực, thì đội ngũ cán bộ ở đây vẫn chưa đáp ứng được.